Maksumenetluse läbiviimine ehk maksukohustuslaste maksude arvestamise ja tasumise õigsuse kontroll on maksukorralduse seadusega reguleeritud Maksu- ja Tolliameti üks olulisi tööülesandeid.
Kontrolli käigus tuvastatakse maksukohustust suurendavad ja vähendavad asjaolud, mida tuleb arvesse võtta maksude määramisel. Maksude arvestamise ja tasumise õigsuse kontroll loetakse lõppenuks maksuotsusega või teatega.
Maksumenetlusi viiakse läbi võimalikult lihtsalt, kiirelt ja efektiivselt, sealjuures on oluline ametnike ja klientide vaheline hea koostöö.
Maksuhaldur ja tema ametnikud on kohustatud hoidma saladuses maksukohustuslast puudutavat teavet, sealhulgas kõiki andmekandjaid (otsused, aktid, teated ja muud dokumendid) maksukohustuslase kohta, äri- ja pangasaladust, mida nad teavad seoses maksude tasumise õigsuse kontrollimise, maksu määramise, maksuvõla sissenõudmise, maksuõigusrikkumise asja menetlemise või muude teenistuskohustuste täitmisega.
Maksukohustuslasel on õigus:
* vajadusel kaasata maksumenetlusse tõlki; kulud katab tõlgi kaasamise taotleja.
* volitada enda nimel tegutsema esindaja;
* taotleda menetlust läbiviiva ametniku taandamist kui ametnik on:
o asjas menetlusosaline või menetlusosalise esindaja,
o esindaja sugulane, hõimlane või perekonnaliige,
o isiklikult huvitatud asja lahendist;
* taotleda menetlustähtaja ennistamist kahe nädala jooksul pärast menetlustoimingu sooritamist takistava asjaolu äralangemist;
* saada revisjoni ajal teavet senituvastatud asjaolude ja nende võimaliku maksustamisalase tähenduse kohta.
Maksukohustuslane on kohustatud:
* andma teavet kõigi maksustamisel tähendust omavate asjaolude kohta;
* aitama kaasa maksustamise seisukohast tähendust omavate asjaolude väljaselgitamisele, andma nende kohta teavet ja esitama tõendid;
* pidama raamatupidamisarvestust raamatupidamise seaduses ning maksuseadustes sätestatud juhtudel ja korras;
* tutvustama kontrollijale raamatupidamissüsteemi ja raamatupidamisega seonduvaid infosüsteeme;
* säilitama tehingute ja väljamaksetega seotud ning muid maksustamise seisukohast tähendust omavaid dokumente vähemalt seitse aastat;
* säilitama maksuarvestuse dokumente muutmata kujul, võimaldamaks nende esialgse sisu kindlakstegemist;
* ametniku nõudel esitama arvestuse tulemusel loodud dokumendid elektrooniliselt, kui on tegemist elektroonilise arvestustuse pidamisega;
* lubama ametnikul takistamatult läbi viia menetlustoiminguid.
Maksukohustuslase õigused ja kohustused tulenevad maksukorralduse seadusest (RT I 2006, 25,186, jõustunud 01.07.2006).
